根据江苏省教育厅文件《省教育厅关于公布“十一五”期间江苏省重点学科名单的通知》（苏教研 [2006] 4 号），“十一五”期间，我校新增14个江苏省重点学科。它们是：植物学、植物营养学、基础兽医学、土地资源管理、微生物学、食品科学、农业信息学、动物营养与饲料科学、临床兽医学、农村发展、生物信息学、科学技术史、果树学、植物检疫与生物安全等14个学科，其中植物学、植物营养学、基础兽医学、土地资源管理等4个学科为国家重点学科培育建设点。“十一五”期间我校江苏省重点学科数比“十五”翻了一番。这些学科分别分布在我校的农学、植保、资环、园艺等11个学院，其中园艺学院、食品学院、人文学院、经管学院首次增设江苏省重点学科。