2021年8月17日，南京农业大学英文学术期刊《植物表型组学》（Plant Phenomics）正式被科睿唯安SCIE（Science Citation Index Expanded）数据库收录，同时进入遥感、植物科学和农学三个分区，自2019年创刊开始的全部文章将被收录。在创刊两年半的时间内被SCIE数据库收录，是对《植物表型组学》期刊质量的高度认可，在此前《植物表型组学》已被CABI、CNKI、DOAJ、PMC和Scopus数据库收录。
Web of Science数据库中《植物表型组学》期刊介绍
《植物表型组学》是由南京农业大学与美国科学促进会（AAAS | Science出版方）合作创办的学术期刊，于2019年1月正式上线发行。期刊采用开放获取形式，刊载植物表型组领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、软件/数据库、方法指南和观点等。期刊主编由东京大学Seishi Ninomiya教授、法国国家农业科学院Frédéric Baret研究员和南京农业大学程宗明教授共同担任。2020年入选中国科技期刊卓越计划高起点新刊项目，于2021年获得国内统一连续出版物号CN32-1898/Q。
期刊官网：spj.sciencemag.org/plantphenomics/
南京农业大学目前拥有三本英文期刊，分别是《园艺研究》《植物表型组学》和《生物设计研究》。
《园艺研究》于2014年1月上线（www.nature.com/hortres），2017年被SCI收录，2018年入选中国科技期刊国际影响力提升计划D类项目，2019年入选中国科技期刊卓越行动计划领军类期刊项目。2020年科睿唯安JCR学科领域排名第一。期刊主编由程宗明教授担任。
《生物设计研究》于2019年11月上线（spj.sciencemag.org/bdr）。美国橡树岭国家实验室Xiaohan Yang高级研究员、英国华威大学Alfonso Jaramillo教授共同担任主编，程宗明教授担任执行主编。