2021年6月30日，科睿唯安2021年度的期刊引证报告（JCR2020）正式发布，《园艺研究》（Horticulture Research）影响因子6.793，位于园艺类一区（第1/37名）；植物科学一区（第14/235名，前6%）;遗传学一区（第20/175名，前12%）这也是《园艺研究》影响因子首次破6。

《园艺研究》是由南京农业大学创办的开放获取英文期刊。2014年1月正式上线发行（www.nature.com/hortres），2017年被SCI收录。2018年入选2018年中国科技期刊国际影响力提升计划D类项目。2019年入选中国科技期刊卓越行动计划领军类期刊项目。期刊主编由南京农业大学程宗明教授担任。

目前我校共有3本英文期刊，除《园艺研究》外，还有和美国科学促进会（AAAS）合作创办的《植物表型组学》（Plant Phenomics）和《生物设计研究》(BioDesign Research)。《植物表型组学》于2019年1月正式上线发行,期刊主编由东京大学Seishi Ninomiya教授、法国国家农业研究院Frédéric Baret教授和南京农业大学程宗明教授共同担任。目前已经正式被CABI、CNKI、DOAJ、PubMed Central和Scopus数据库收录，正在ESCI收录考核期。《生物设计研究》于2019年11月正式上线。美国橡树岭国家实验室Xiaohan Yang高级研究员，英国华威大学Alfonso Jaramillo教授共同担任期刊主编，南京农业大学程宗明教授担任执行主编。目前已经正式被CNKI、DOAJ数据库收录。