2012年4月，经江苏省科技厅、教育厅推荐，省政府同意申报，南京农业大学获教育部、科技部正式批准成为全国首批10所成立新农村发展研究院的高校之一。
新农村发展研究院依托南京农业大学雄厚的师资力量和丰硕的科研成果，围绕长三角区域现代化农业发展需求，丰富服务内涵，创新服务模式，为实现世界一流农业大学的宏伟目标，推动江苏省实现“两个率先”打造强富美高新农村及实现全国农业现代化做出了积极贡献。
示范基地
南京农业大学新农村发展研究院（以下简称“南农大新农院”）坚持“立足江苏，侧重华东，辐射全国”的布局原则，紧紧围绕区域新农村建设综合需求，积极开展新农村服务基地建设，共建有4个综合示范基地、5个特色产业基地和18个分布式服务站，正在培育20余个新农村服务基地。
位于江苏省常熟市的常熟新农村发展研究院是南农大新农院建设的综合示范基地之一。作为建设‘产镇人文’四位一体的新型创新创业发展平台和基于全域旅游的农业特色小镇，董浜镇是常熟市建设新型城镇化的一个突破口。自2013年6月常熟新农村发展研究院入驻董浜镇以来，积极开发引进名特优农产品，进行特色农产品的资源开发和融合发展，为把董浜镇打造成“蔬果特色小镇”发挥了重要作用。
南京农业大学校长周光宏指出，南京农业大学要实现建设世界一流农业大学的宏伟目标，不仅要做到“顶天”，也要做到“立地”，南农大新农院要积极组织科研人员开展农技推广项目，增强学校的社会服务职能。南农大新农院成立5年来，学校组织承担了财政部、农业部重大农技推广试点工作、科技部“十二五国家科技支撑项目”、江苏省“挂县强农富民”工程项目等，项目累计经费6000多万，依托项目建设、升级各类科研试验基地、区域示范基地等30多个，推广新品种、新技术500余项。结合江苏农业发展现状，积极探索“科研试验基地+区域示范基地+基层推广服务体系+新型农业经营主体”的链式农技推广服务模式。
双线共推
近年来，南农大新农院积极转变过去“科技大篷车”服务手段，丰富“双百工程”服务内容，借助“互联网+农技推广”及各级农技推广项目，线下联合地方农业主管部门共同组建新型农业经营主体联盟开展技术示范与培训指导，线上自主开发了“南农易农”手机APP，实现答疑解惑与推送信息实时互动。线上线下紧密互动，构建“线下建联盟、线上做服务”的“双线共推”农村科技服务新模式，成为南京农业大学科技服务农业供给侧结构性改革的重要抓手。
截至目前，已在江苏探索建立新型农业经营主体联盟6个，服务新型农业经营主体超过2000家。“南农易农”APP在线用户已超过3000个，发送各类信息10000余条。十三五期间，力争再建联盟10个，通过“南农易农”APP服务新型农业经营主体超过10000家。
“双线共推”服务模式给新型职业农民做示范，提高相关产业农产品质量。南京农业大学副校长丁艳锋说：“通过‘双线共推’服务模式搭建起线上高速运行的新时代‘科技大篷车’，线下校地农协同共赢的新常态‘双百工程’”。
定点扶贫
南京农业大学党委书记、新农村发展研究院院长左惟在扶贫工作研讨会上常说，南京农业大学作为中共中央组织部、国务院扶贫办等部委确定的开展定点扶贫工作的44所高校之一，肩负着实施国家扶贫攻坚重大战略的历史使命，具有义不容辞的责任，要为经济社会发展特别是解决“三农”问题作出更大贡献。
2016年，南京农业大学重新调整扶贫工作机构，成立扶贫开发领导小组，由校党委书记任组长，分管校领导担任副组长，党委办公室、校长办公室、新农村发展研究院办公室等14个学校职能部门主要负责人纳入成员，全校一盘棋，共同参与扶贫开发工作。
南农大新农院积极响应的党的号召，瞄准地方特色产业资源优势与需求，构建“产业技术+示范推广+人才+农户”扶贫模式，协助贵州省麻江县、江苏省灌南县、江西省井冈山市等地区做好产业精准扶贫脱贫工作，委派年轻干部挂职副县长和“村第一书记”，为实施科教兴县和人才强县战略提供坚强的人才支撑和智力支持。例如，通过在江西省井冈山市设立扶贫专家工作站，开展各类对接帮扶，为井冈山市在全国率先脱贫“摘帽”做出了重要贡献；再如，在贵州省麻江县打造“状元故里”菊花谷示范项目，指导高枧村村民参与20亩示范基地建设。一年内吸引游客3万余人，村集体卖盆花和花茶直接增加收入20万元，让村民们实实在在看到了产业技术示范结出的硕果。今后，南农大新农院还将升级扶贫模式，推出“立体式全产业链服务带动产业脱贫”模式，多方汇集资源，用“授之以渔而非授之以鱼”的思路，让贫困地区实现自身造血功能。
创新创业
南农大新农院联合江苏团省委、省教育厅、省农委，新农院院务委员会成员单位学工处、团委等部门，积极推进实施“优秀大学生涉农创业工程”，成立了南京农业大学大学生创新创业教育工作领导小组，制订并出台了《南京农业大学创新创业教育实施方案》，培育出一批“农场卫士2.0”、“都市E农庄”(现实版的开心农场)等创新创业项目。
邓海啸是南京农业大学工学院自动化专业2016届本科毕业生。在校期间，自己尝试创立社团——海啸航模协会。此后，制作完成了30架无人飞机，将无人飞机从过去“玩家家”式的“瞎倒腾”变成了与专业兴趣相关的科研。2015年2月5日，邓海啸与创业伙伴用63万元的注册资本创立了“南京金快快网络科技有限公司”。主营植保无人机的研发和销售、无人机农药喷洒服务、无人机教育培训服务三项内容。
这个特立独行的学生创客吸引了南京农业大学新农村发展研究院创新创业教育工作领导小组的目光，为了让他的创业更加顺利，学校给予团队实操实测产品的支撑。经过短短一年的摸索和研发，邓海啸的公司净利润已达33.7万元。
农为邦本，农兴邦固。南京农业大学新农村发展研究院正在新一轮农村、农业改革发展之中诠释着自己的使命和担当。