按照教育部、卫生部通知要求，校医院在第一时间迅速进入甲型H1N1流感防控状态，采取多项措施，紧急部署甲型H1N1流感防控工作。积极开展H1N1流感基本常识和预防知识的宣传教育活动，做到早预防、早发现、早隔离、早治疗。
今年6月我国陆续出现输入性甲型H1N1流感病例，根据上级卫生部门指示，迅速出台《校医院防控甲型H1N1流感预案》，成立了由院领导牵头、预防保健科主要负责、各部门相互配合的校医院防控甲流领导小组，并多次组织全院医务人员学习甲型H1N1流感的诊断、治疗及预防措施等相关知识，加强医护人员自身防护教育。按上级卫生部门的要求，校医院已于上学期末就设立预诊分诊点及发热门诊，加强该两部门的规范化管理。为发热病人发放一次性口罩，测量体温。采取发热病人分流，可疑患者隔离治疗等积极措施，市、区卫生监督所、疾控中心多次来院督导、检查，均达到要求。
经历了炎热的酷暑，肆虐的病毒依然传播蔓延，全国各大省份学校相继发现甲流病例。新学期第一天，我院布置具体工作、责任到人，要求每位医务人员都积极主动的参与到这场与甲流抗争的硬仗中来。
9月9日接到市卫生局通知，高校出现甲流确诊病例和疑似病例就地隔离治疗，校医院领导高度重视，当晚召集有关人员开会，为防治甲流群策群力、布置工作，医院想方设法，四处联系，在第一时间筹集甲流治疗所需药品和消毒防护物品。校医院承担了防控甲流的大量工作，近几天医院日门诊量高达500多人次，日输液治疗90多人次。在克服人员少、任务重、压力大等诸多困难，还要确保今年来自全国各地的近5000名新生体检工作的正常、有序、安全完成，全院上下每位医务人员都准备随时被调遣到需要的岗位，有部分同志没有节假日休息，加班加点坚持在为患者服务的第一线，几位医务人员继续带病参加工作确保校医院工作的正常开展。
面对南京一些高校出现的个别病例，我校部分学生出现了不同程度的恐慌情绪，医生们在进行医疗护理的同时，担负起心理疏导的职责。告诉同学们甲流是可防可治的。预防措施主要是切断传染途径，增强自身免疫力；要求同学们做到：1、不要去人群密集的公众场所，避免与有发热症状的人密切接触；；2、不要到有疫情的地方去；3、保持良好的心态，积极锻炼，增强免疫力，勤洗手、多喝水、保证睡眠，经常开窗通风，保持空气流通、清新，注意个人卫生。
在学校的正确领导下，各部门密切配合，监测学生身体状况，凡有发热并伴有呼吸道症状的学生及时到校医院就诊，并告知学院及负责老师，目前防控工作总体有序进行，防控效果显著。